相对而言盟军的撤退反而惬意了许多，它们凭借着幻影坦克的裂缝发生器神不知鬼不觉的将散落在城市周围的部队集结了起来。随后利用雅典娜加农炮的远程攻击力和变态的神盾防御系统。成功的突破了一道又一道封锁线。可惜的是虽然重武器损失不大，但为了对付天上的麻烦防空战车却在掩护突围时消耗殆尽。
为了帮助城内两国部队从陷阱中尽快脱身，在横滨的联军部队动用了所有远程火力疯狂的向东京城内倾泻着怒火，无数远程炮弹，巡航导弹密集的砸向城内旭日帝国的主要军事基地。搞的后来旭日帝国不得不启动纳米虫群屏障保护自己的基地安全了。只不过那东西也不是万能的，空军基地的彻底毁灭就是一个最好的例子。
谁让他们在遭到盟军超级武器—质子对撞炮攻击时，罩上纳米虫群屏障.........。结果本来也就能把机场摧毁的攻击，演变成了毁灭整个空军基地的大爆炸........！不但停放在里面的大量神风无人机全都了报销，顺便还干掉了不少回来检修的旭日帝国空军战机。巨大的损失搞得旭日帝国后续的围歼计划更加难以有效实施了。
经过了初期的混乱彷徨后，两国联军在付出了极大伤亡后终于在城中站稳了脚跟并控制了一部分城区。只是和初期进城时的三百多万大军相比，剩下的部队已经不到当初进城的一半军力，更糟糕的是受伤的伤员数量就占了整整三分之一。要不是盟军拥有超时空传送仪能够进行短距离传送，恐怕其中大多数重伤者很难活着离开这座城市了。
不过旭日帝国那头也不怎么好受，这次包围本来十拿九稳。可是华国突然对东京外围城市的攻击打乱了初期的部署，导致隐蔽在外围城市的许多部队被华**队缠住。虽然城内的战斗取得的效果还是很辉煌的，可是围歼战打成了现在的拉锯战这就很失败了。
而横滨方向意外的炮火袭击让城内的旭日帝国追击部队很是受伤。受到无线电静默的影响，导致了横滨被完全占领的消息情报部门一直没有接到。所以在没有防备情况下，遭到了突然的火力急袭，结果这场计划以外的攻击几乎摧毁了旭日帝国所有的装甲部队。甚至连天空中的那三台超级要塞也被密集的巡航导弹给干掉了两台。最糟糕的是本来用于最后一击的神风无人机群，由于空军基地莫名其妙的彻底毁灭而宣告破产。
地面上的步兵部队的损失那就更严重了，有几个独立师团在密集的炮击中干脆就被除名了。那些炮弹简直变态到了极点，居然一枚炮弹里面还有几百枚小炸弹，而炮弹中装的还全是钢珠，不过最可恨的是那东西居然还有跟踪功能........！在这种突然的覆盖性的打击下想不死都困难。不过更麻烦的还在后面，华国攻击部队不知道用了什么方法，居然只用了不到6个小时就摆平了外围城市隐藏的三百多万大军，这简直太让人难以置信了。
他们并不知道，华国这80多万部队中几乎一大半都是参加过上海会战的老兵，而其中大多数还都是装备更加先进武器的次元政府国防军成员。真正的**的军队只占了极少的一部分，大概也就不到十几万人吧。不过这些都不足以如此迅速的解决那三百多万旭日帝国大军。真正干掉他们的是秘密参战的十五支影子部队特别行动组和三个战斗力极强机械兵团。解决了城外的麻烦后，华**队迅速的突破了东京外围的封锁线，很快就与残存的联军完成了会合。
随后三方部队经过简单整备后开始再次向旭日帝国的核心区域天皇宫前进。在华国神罚战机的配合下，轻易的消灭了对方的所有空军部队。随后更是彻底摧毁了宫殿四周的三座重要军事基地，并成功突破了皇宫周围设下的三道坚固防线。虽然部队前进过程中也遭到了对方超级武器超能波毁灭装置的数次袭击，但在苏军动用铁幕装置保护下，成功的抵挡住了巨型超能波的毁灭性打击。而那些装置在发射之后，就已经不可避免的暴漏了自己的位置。虽然对方有纳米屏障的保护，但是结果依然是被无数钻地飞弹炸成了碎片。连带着那些纳米蜂箱也被一并处理了。
在30秒真男人的无敌光环保护下联军装甲部队成功的完成对皇宫的合围作战，只不过部队在对帝国最后的据点发动总攻时，却遭到了前所未有的激烈抵抗。旭日帝国最为精锐的近卫师团强大的战斗力让进攻部队损失惨重。而不断从地下冒出的仿生人部队更是给进攻部队造成了极大的阻力。为了尽快拿下这里，干掉该死的天皇芳朗同学，联军的各种隐藏手段纷纷亮了出来。
苏军指挥官尼克莱.莫斯文凭借自己的权限，将太空那点破烂卫星全都倾泻到了皇宫周围的密集防御上造成了守军极大的损失。为了加强破坏效果，这家伙随后又将已经报废多年的礼炮和联盟空间站都给砸了下来！苏军废物利用的作战手段实在让人叹为观止，值得我们认真学习。
只不过和盟军的指挥官华伦.富勒的手段比起来，还是有些小巫见大巫了。因为这家伙居然先使用了大范围冰冻技术，将皇宫周围的几座极度坚固要塞冻住，随后又使用传送技术，把各种型号的定时炸弹部署到周围。结果坚固的要塞就这样被阴掉了阴掉了......！战局一下子变得对联军有利了起来，不过从远方突然赶来的旭日帝国超级要塞又再一次将联军的地面攻势打的粉碎。在数百名火箭天使的簇拥下，仅存的超级要塞不断的使用破坏力惊人的电离光束，造成了三国联军地面部队极大的伤亡。双方的战斗愈演愈烈，伤亡也在不断增加........。